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商船學系學士後多元專長培力課程專班
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輪機工程學系學士後多元專長培力課程專班
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海洋經營管理學士學位學程(系)
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採3+1制度，一年在馬祖校區上課
海洋觀光管理學士學位學程(系)
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採3+1制度，一年在馬祖校區上課
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海洋生物科技博士學位學程
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輪機工程學系學士後多元專長培力課程專班
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採3+1制度，一年在馬祖校區上課
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