培育具備海洋科學、資源及海洋事務管理能力，並兼具人文素養之人才。

海洋科學的重點特色在於海洋物理、化學、生物、地質、資訊、全球氣候變遷、海岸變遷、海洋遙測、水下科技、地震與斷層之監測；海洋資源相關科技的重點特色在於海洋資源探勘與發展永續利用、環境生態保全、和大陸礁層資源調查；此外，本院也積極擴展海洋事務、策略和管理等相關領域之研究，以維護國家的權益，實現『海洋國家』之理想。另為擴大競爭優勢，本院透過跨系所、海域國土與海底資源領域、海洋事務與漁業領域、海洋環境監測與災害領域、氣候變遷領域與海洋能源領域等六大特色領域。

地球科學學程、地理資訊應用學程、環境生物學程、漁業科學學程、海洋事務與資源管理學程、海洋休閒學程。