本所教師專長涵蓋海洋生物之病毒、微生物、浮游植物、浮游動物、海洋真菌、海洋無脊椎動物、海藻、魚類及底棲生態等各領域，同時亦各兼具生理、行為、生化、分子生物、統計、遺傳、電腦、環境、海洋、教育等不同學門的專長，可傳授學生完整之海洋生物知識。
本所以分類與生態為本所研究與發展之特色，以支援國內各項與海洋生物相關之漁業、工業、醫藥、教育、環保、經建等相關之研究發展與資源之開發利用。